هیئت امنای مؤسسه متشکل از اعضای هیئت علمی دانشگاهها ، نماینده استاندار و نماینده وزیر علوم، تحقیقات وفناوری می باشد. هیئت امنای مؤسسه به مدت 4 سال و توسط وزیر محترم علوم،تحقیقات و فناوری منصوب میشوند.

اعضای هیئت امناء:

1-آقای دکتر سید حسین نوعی

2-آقای دکتر امین رضا کمالیان

3-آقای مهندس محمد فاضل نسب

4- آقای دکتر علی اصغر رستمی ( نماینده وزیر محترم علوم ، تحقیقات و فناوری )

5-حجت الاسلام و المسلمین محسن هاشمی گنابادی

6-دکتر محمد حسن نشاطی

7-آقای دکتر محسن کاهانی

8-آقای دکتر محمد رضا اکبرزاده توتونچی

9-آقای دکتر علی کیانی فر

10-آقای مهندس سعید حسین پور(با حکم استاندار محترم خراسان رضوی)